Etelä-Pohjanmaan Järvialueen KOKO on liittynyt seuraaviin koheesio- ja kilpailukyky -ohjelmassa toimiviin valtakunnallisiin verkostoihin:

Innovaatio ja osaaminen -verkosto

- hallinnoija Seinäjoen teknologiakeskus
- yhteyshenkilö alueella yrityspalvelupäällikkö Jouko Etula

Matkailuverkosto

- hallinnoija Kalajoen kaupunki
- yhteyshenkilö alueella yritysneuvoja Pirkko Ylätalo

Russia
- hallinnoija SEKES ry. - Seudulliset kehittämisyhteisöt
- yhteyshenkilö alueella kehittämispäällikkö Juha Lehtineva